Hola
Que version de ESX y VCenter estas usando? 3.5 Ux?? vsphere?
Es raro que al unirlo al dominio te de esos errores, has probado a resetear el agente de los ESX una vez el VCenter esta en el dominio? quizas use diferente credenciales o diferentes key's.
Has mirado si hay algun error en los logs? /var/log/vmkernel?
A mi me pasaba lo mismo pero entre ESX y el VCenter, porque tenia un firewall en medio que me cortaba las sesiones IDE demasiado pronto, con el VCenter U5 se soluciono.
Saludos
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